W Aptece pod Orłem, położonej w obrębie dawnego krakowskiego getta, znajdowała się apteka prowadzona w okresie okupacji przez Tadeusza Pankiewicza (który nie był żydowskiego pochodzenia). Muzeum upamiętnia zagładę Żydów krakowskich i przybliża historię getta oraz rolę apteki w jego codziennym funkcjonowaniu.